شورای عالی اداری طی جلسه هشتم اسفند ماه 1403 مرکز آموزش عالی هوانوری و فرودگاهی کشور و دو مرکز آموزش عالی دیگر را به موارد استثناء شده از مصوبه سال 1390 این شورا اضافه کرد و بدین ترتیب دانشکده می تواند با ساختار کنونی به فعالیت خود ادامه دهد.
در جلسه 8 اسفندماه 1403 شورای عالی اداری که به ریاست آقای دکتر عارف معاون اول رییس جمهوری و با حضور وزرای علوم تحقیقات و فناوری، تعاون کار و رفاه اجتماعی، آموزش و پرورش، بهداشت درمان و آموزش پزشکی، امور خارجه و روسای سازمان های اداری و استخدامی ،برنامه و بودجه و همچنین مسئولان دستگاه های اجرایی مربوطه برگزار شد، تصویب نامه شورای عالی اداری سال 1390 مبنی بر ساماندهی موسسات آموزشی و پژوهشی دستگاه های اجرایی را مورد بررسی قرار داد و پس از بررسی، مرکز آموزش عالی هوانوردی و فرودگاهی کشور، دانشکده روابط بین الملل وزارت امور خارجه موسسه آموزش عالی آموزش و پرورش و مدیریت و برنامه ریزی وابسته به سازمان برنامه و بودجه را به موارد استثناء از مصوبه سال 1390 این شورا اضافه کرد.
لازم به ذکر است بر اساس مصوبات شورای عالی اداری در سنوات قبل با عنوان ساماندهی مراکز آموزش عالی وابسته به دستگاه های اجرایی ، این مراکز در دو راهی انحلال و یا ادغام در یکی از دانشگاه های وزارت علوم، تحقیقات و فناوری قرار گرفتند. همچنین بر اساس مصوبه سال 1396، وزارت علوم جذب دانشجو در سال های 1396 و 1397 در دانشکده از طریق کنکور سراسری را متوقف کرد. هر چند که با توجه به دلایل مرتبط با امنیت ملی و جایگاه ویژه مرکز، جذب دانشجو از سال 1398 به صورت موقت مجددا آغاز شد اما ادامه آن به تعیین تکلیف جایگاه ساختاری مرکز موکول گردید.
با پی گیری های مستمر دانشکده و از آنجا که هیچ یک از دانشگاه های کشور برای اجرای رشته های تخصصی صنعت هوانوری اعلام آمادگی ننمودند و همچنین امکان انتقال مرکز به سایر دانشگاه ها به دلایل فنی و امنیت ملی وجود نداشت، علاوه بر شورای گسترش وزارت علوم ؛وزاری راه و شهر سازی در سال های 1399 و 1401 ونیز وزاری علوم، تحقیقات و فناوری نیز طی چهار نوبت در سال های 1399، 1400 و 1401 نظر کتبی خود را مبنی بر لزوم مستثنی شدن مرکز از مصوبه مذکور به سازمان اداری و استخدامی اعلام کردندکه این جمع بندی مورد تایید رییس سازمان اداری و استخدامی وقت نیز قرار گرفت اما تا آذر ماه سال 1401 امکان طرح موضوع در شورای عالی اداری فراهم نشد و هر چند که این موضوع در جلسه این شورا در سال 1401 مورد بررسی قرار گرفت اما به دلیل برخی حواشی به جمع بندی نهایی نرسید تا نهایتا با پی گیری های مستمر در جلسه 8 اسفند 1403 در جلسه شورا مطرح و مستثنی شدن مرکز مورد تصویب قرار گرفت.
بر این اساس مرکز می تواند با ساختار وابسته به سازمان هواپیمایی کشوری در بخش های آکادمیک مانند جذب هیات علمی، پذیرش دانشجوی آکادمیک و در رشته های تخصصی مرتبط با صنعت هوانوردی بر اساس مقررات وزارت علوم به فعالیت خود ادامه دهد.
دکتر اردوان کریم زاده سرپرست مرکز ضمن تشکر از تلاش و کوشش و پیگری و پشتیبانی کلیه افرادی که در تحقق این امر خطیر و مهم سهیم بودند، طی نامه ای ضمن تقدیر از پی گیری های مستمر و مشفقانه آقای دکتر پورفرزانه ریاست محترم سازمان هواپیمایی کشوری که طرح موضوع و اخذ مصوبه اخیر را به دنبال داشت گام های بعدی را پس از حل مشکل توقف ساختاری 20 ساله مرکز، اصلاح و تقویت ساختارسازمانی ، اخذ مجوز رشته های جدید و توسعه آموزش های مورد نیاز صنعت و ایجاد ارتباطات بین المللی و نهایتا تبدیل دانشکده به قطب آموزش صنعت هوانوردی، عنوان کرد که برنامه تفصیلی آن جهت تایید ریاست سازمان ارائه خواهد شد
